Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK18

OGFOD3, 2-oxoglutarate and iron-dependent oxygenase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OGFOD3Q6PK18 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OGFOD3Q6PK18 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OGFOD3Q6PK18 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OGFOD3Q6PK18 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OGFOD3Q6PK18 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OGFOD3Q6PK18 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OGFOD3Q6PK18 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OGFOD3Q6PK18 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OGFOD3Q6PK18 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OGFOD3Q6PK18 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OGFOD3Q6PK18 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OGFOD3Q6PK18 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OGFOD3Q6PK18 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OGFOD3Q6PK18 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OGFOD3Q6PK18 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OGFOD3Q6PK18 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OGFOD3Q6PK18 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OGFOD3Q6PK18 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OGFOD3Q6PK18 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OGFOD3Q6PK18 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
OGFOD3Q6PK18 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OGFOD3Q6PK18 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OGFOD3Q6PK18 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OGFOD3Q6PK18 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
OGFOD3Q6PK18 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
OGFOD3Q6PK18 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OGFOD3Q6PK18 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OGFOD3Q6PK18 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OGFOD3Q6PK18 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OGFOD3Q6PK18 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OGFOD3Q6PK18 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OGFOD3Q6PK18 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OGFOD3Q6PK18 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OGFOD3Q6PK18 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OGFOD3Q6PK18 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms