Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO42Q6P3S6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO42Q6P3S6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO42Q6P3S6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO42Q6P3S6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms