Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
LCN12Q6JVE5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LCN12Q6JVE5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LCN12Q6JVE5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LCN12Q6JVE5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms