Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCSD1Q6JBY9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RCSD1Q6JBY9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RCSD1Q6JBY9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms