Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUMO4Q6EEV6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUMO4Q6EEV6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUMO4Q6EEV6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUMO4Q6EEV6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms