Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCARA3Q6AZY7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCARA3Q6AZY7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SCARA3Q6AZY7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCARA3Q6AZY7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCARA3Q6AZY7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SCARA3Q6AZY7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCARA3Q6AZY7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCARA3Q6AZY7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCARA3Q6AZY7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCARA3Q6AZY7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCARA3Q6AZY7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SCARA3Q6AZY7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCARA3Q6AZY7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCARA3Q6AZY7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCARA3Q6AZY7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCARA3Q6AZY7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCARA3Q6AZY7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCARA3Q6AZY7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCARA3Q6AZY7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SCARA3Q6AZY7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCARA3Q6AZY7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCARA3Q6AZY7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCARA3Q6AZY7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCARA3Q6AZY7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCARA3Q6AZY7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SCARA3Q6AZY7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCARA3Q6AZY7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SCARA3Q6AZY7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCARA3Q6AZY7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCARA3Q6AZY7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCARA3Q6AZY7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCARA3Q6AZY7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCARA3Q6AZY7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCARA3Q6AZY7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCARA3Q6AZY7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCARA3Q6AZY7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCARA3Q6AZY7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCARA3Q6AZY7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCARA3Q6AZY7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCARA3Q6AZY7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCARA3Q6AZY7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCARA3Q6AZY7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCARA3Q6AZY7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCARA3Q6AZY7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCARA3Q6AZY7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCARA3Q6AZY7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCARA3Q6AZY7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCARA3Q6AZY7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCARA3Q6AZY7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCARA3Q6AZY7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCARA3Q6AZY7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCARA3Q6AZY7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCARA3Q6AZY7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCARA3Q6AZY7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCARA3Q6AZY7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCARA3Q6AZY7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCARA3Q6AZY7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms