Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EEF1DP3Q658K8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EEF1DP3Q658K8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EEF1DP3Q658K8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EEF1DP3Q658K8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
EEF1DP3Q658K8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEF1DP3Q658K8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EEF1DP3Q658K8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EEF1DP3Q658K8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EEF1DP3Q658K8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EEF1DP3Q658K8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EEF1DP3Q658K8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EEF1DP3Q658K8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms