Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLX4IPQ5VYV7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLX4IPQ5VYV7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLX4IPQ5VYV7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLX4IPQ5VYV7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLX4IPQ5VYV7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLX4IPQ5VYV7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLX4IPQ5VYV7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLX4IPQ5VYV7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLX4IPQ5VYV7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLX4IPQ5VYV7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLX4IPQ5VYV7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLX4IPQ5VYV7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLX4IPQ5VYV7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLX4IPQ5VYV7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLX4IPQ5VYV7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLX4IPQ5VYV7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLX4IPQ5VYV7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLX4IPQ5VYV7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLX4IPQ5VYV7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLX4IPQ5VYV7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLX4IPQ5VYV7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4IPQ5VYV7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms