Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SDHAF4Q5VUM1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SDHAF4Q5VUM1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SDHAF4Q5VUM1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SDHAF4Q5VUM1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SDHAF4Q5VUM1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SDHAF4Q5VUM1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SDHAF4Q5VUM1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDHAF4Q5VUM1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDHAF4Q5VUM1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SDHAF4Q5VUM1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SDHAF4Q5VUM1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDHAF4Q5VUM1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDHAF4Q5VUM1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDHAF4Q5VUM1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDHAF4Q5VUM1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDHAF4Q5VUM1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDHAF4Q5VUM1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDHAF4Q5VUM1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDHAF4Q5VUM1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SDHAF4Q5VUM1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SDHAF4Q5VUM1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SDHAF4Q5VUM1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SDHAF4Q5VUM1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SDHAF4Q5VUM1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms