Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPO2Q5TGU0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPO2Q5TGU0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPO2Q5TGU0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPO2Q5TGU0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPO2Q5TGU0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.7 ms