Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRV8

TMEM255A, Transmembrane protein 255A, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM255AQ5JRV8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM255AQ5JRV8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM255AQ5JRV8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM255AQ5JRV8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM255AQ5JRV8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM255AQ5JRV8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM255AQ5JRV8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM255AQ5JRV8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM255AQ5JRV8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM255AQ5JRV8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM255AQ5JRV8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM255AQ5JRV8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM255AQ5JRV8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM255AQ5JRV8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM255AQ5JRV8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM255AQ5JRV8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM255AQ5JRV8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM255AQ5JRV8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM255AQ5JRV8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM255AQ5JRV8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM255AQ5JRV8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM255AQ5JRV8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms