Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSD17B12Q53GQ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSD17B12Q53GQ0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSD17B12Q53GQ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSD17B12Q53GQ0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms