Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TBRG1Q3YBR2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBRG1Q3YBR2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBRG1Q3YBR2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TBRG1Q3YBR2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBRG1Q3YBR2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms