Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PROX2Q3B8N5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROX2Q3B8N5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROX2Q3B8N5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PROX2Q3B8N5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROX2Q3B8N5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROX2Q3B8N5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROX2Q3B8N5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROX2Q3B8N5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROX2Q3B8N5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROX2Q3B8N5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROX2Q3B8N5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROX2Q3B8N5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PROX2Q3B8N5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROX2Q3B8N5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROX2Q3B8N5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROX2Q3B8N5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROX2Q3B8N5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PROX2Q3B8N5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROX2Q3B8N5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROX2Q3B8N5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms