Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPEL1Q2QD12 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPEL1Q2QD12 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPEL1Q2QD12 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPEL1Q2QD12 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms