Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CTC1Q2NKJ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CTC1Q2NKJ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTC1Q2NKJ3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms