Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC142Q17RM4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC142Q17RM4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC142Q17RM4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC142Q17RM4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC142Q17RM4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC142Q17RM4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC142Q17RM4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC142Q17RM4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC142Q17RM4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC142Q17RM4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC142Q17RM4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC142Q17RM4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC142Q17RM4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC142Q17RM4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC142Q17RM4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC142Q17RM4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC142Q17RM4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC142Q17RM4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC142Q17RM4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC142Q17RM4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC142Q17RM4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC142Q17RM4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
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