Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP6V1FQ16864 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP6V1FQ16864 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V1FQ16864 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6V1FQ16864 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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