Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
RASGRF1Q13972 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RASGRF1Q13972 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RASGRF1Q13972 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RASGRF1Q13972 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RASGRF1Q13972 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RASGRF1Q13972 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RASGRF1Q13972 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RASGRF1Q13972 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RASGRF1Q13972 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RASGRF1Q13972 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RASGRF1Q13972 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RASGRF1Q13972 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RASGRF1Q13972 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RASGRF1Q13972 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RASGRF1Q13972 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RASGRF1Q13972 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RASGRF1Q13972 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RASGRF1Q13972 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RASGRF1Q13972 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RASGRF1Q13972 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
RASGRF1Q13972 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RASGRF1Q13972 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
RASGRF1Q13972 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RASGRF1Q13972 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RASGRF1Q13972 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RASGRF1Q13972 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RASGRF1Q13972 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RASGRF1Q13972 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RASGRF1Q13972 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RASGRF1Q13972 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RASGRF1Q13972 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RASGRF1Q13972 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RASGRF1Q13972 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RASGRF1Q13972 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RASGRF1Q13972 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RASGRF1Q13972 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RASGRF1Q13972 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RASGRF1Q13972 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
RASGRF1Q13972 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RASGRF1Q13972 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RASGRF1Q13972 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
RASGRF1Q13972 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RASGRF1Q13972 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RASGRF1Q13972 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RASGRF1Q13972 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RASGRF1Q13972 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RASGRF1Q13972 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RASGRF1Q13972 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RASGRF1Q13972 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RASGRF1Q13972 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RASGRF1Q13972 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RASGRF1Q13972 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RASGRF1Q13972 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RASGRF1Q13972 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
RASGRF1Q13972 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms