Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C1Q12789 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C1Q12789 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C1Q12789 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF3C1Q12789 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
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