Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPL6Q02878 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPL6Q02878 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPL6Q02878 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL6Q02878 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL6Q02878 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL6Q02878 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL6Q02878 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL6Q02878 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL6Q02878 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms