Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BNC1Q01954 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BNC1Q01954 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BNC1Q01954 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BNC1Q01954 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BNC1Q01954 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BNC1Q01954 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BNC1Q01954 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BNC1Q01954 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BNC1Q01954 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BNC1Q01954 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BNC1Q01954 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BNC1Q01954 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BNC1Q01954 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BNC1Q01954 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BNC1Q01954 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms