Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSF1Q00613 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HSF1Q00613 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSF1Q00613 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSF1Q00613 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms