Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFNB1P98172 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNB1P98172 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNB1P98172 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNB1P98172 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNB1P98172 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms