Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3F3AP84243 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3F3AP84243 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3F3AP84243 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3F3AP84243 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms