Protein–RNA interactions for Protein: P82251

SLC7A9, b(0,+)-type amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A9P82251 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC7A9P82251 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC7A9P82251 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC7A9P82251 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC7A9P82251 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC7A9P82251 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC7A9P82251 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC7A9P82251 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC7A9P82251 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC7A9P82251 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC7A9P82251 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC7A9P82251 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC7A9P82251 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC7A9P82251 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC7A9P82251 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC7A9P82251 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC7A9P82251 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC7A9P82251 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC7A9P82251 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC7A9P82251 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC7A9P82251 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC7A9P82251 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC7A9P82251 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC7A9P82251 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC7A9P82251 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC7A9P82251 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC7A9P82251 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC7A9P82251 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC7A9P82251 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC7A9P82251 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC7A9P82251 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC7A9P82251 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC7A9P82251 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC7A9P82251 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC7A9P82251 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC7A9P82251 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC7A9P82251 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC7A9P82251 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC7A9P82251 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC7A9P82251 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC7A9P82251 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC7A9P82251 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC7A9P82251 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC7A9P82251 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC7A9P82251 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC7A9P82251 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC7A9P82251 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC7A9P82251 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC7A9P82251 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC7A9P82251 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC7A9P82251 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC7A9P82251 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC7A9P82251 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms