Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBA52P62987 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBA52P62987 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBA52P62987 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBA52P62987 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBA52P62987 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBA52P62987 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBA52P62987 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBA52P62987 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBA52P62987 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBA52P62987 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBA52P62987 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBA52P62987 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBA52P62987 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBA52P62987 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA52P62987 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA52P62987 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA52P62987 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA52P62987 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA52P62987 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBA52P62987 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA52P62987 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA52P62987 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA52P62987 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA52P62987 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA52P62987 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA52P62987 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA52P62987 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBA52P62987 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBA52P62987 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA52P62987 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA52P62987 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA52P62987 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA52P62987 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA52P62987 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA52P62987 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA52P62987 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA52P62987 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA52P62987 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA52P62987 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA52P62987 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA52P62987 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA52P62987 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA52P62987 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA52P62987 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA52P62987 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA52P62987 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA52P62987 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA52P62987 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA52P62987 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA52P62987 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBA52P62987 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA52P62987 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA52P62987 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA52P62987 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA52P62987 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBA52P62987 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBA52P62987 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA52P62987 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA52P62987 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA52P62987 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBA52P62987 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA52P62987 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA52P62987 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA52P62987 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA52P62987 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA52P62987 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBA52P62987 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA52P62987 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA52P62987 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA52P62987 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA52P62987 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA52P62987 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA52P62987 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA52P62987 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBA52P62987 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBA52P62987 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBA52P62987 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBA52P62987 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBA52P62987 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBA52P62987 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBA52P62987 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBA52P62987 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBA52P62987 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBA52P62987 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA52P62987 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA52P62987 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA52P62987 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA52P62987 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA52P62987 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA52P62987 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA52P62987 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBA52P62987 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBA52P62987 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBA52P62987 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBA52P62987 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBA52P62987 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA52P62987 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA52P62987 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA52P62987 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms