Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GSDMDP57764 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GSDMDP57764 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GSDMDP57764 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GSDMDP57764 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GSDMDP57764 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GSDMDP57764 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GSDMDP57764 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GSDMDP57764 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GSDMDP57764 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GSDMDP57764 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GSDMDP57764 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GSDMDP57764 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GSDMDP57764 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GSDMDP57764 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GSDMDP57764 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GSDMDP57764 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms