Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB38P57729 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB38P57729 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB38P57729 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB38P57729 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB38P57729 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB38P57729 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB38P57729 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB38P57729 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB38P57729 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
RAB38P57729 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB38P57729 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB38P57729 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB38P57729 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB38P57729 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB38P57729 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB38P57729 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB38P57729 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAB38P57729 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAB38P57729 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB38P57729 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB38P57729 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB38P57729 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB38P57729 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB38P57729 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB38P57729 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB38P57729 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB38P57729 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB38P57729 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB38P57729 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB38P57729 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB38P57729 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB38P57729 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB38P57729 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB38P57729 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB38P57729 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB38P57729 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB38P57729 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB38P57729 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB38P57729 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB38P57729 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB38P57729 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB38P57729 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB38P57729 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB38P57729 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB38P57729 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB38P57729 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB38P57729 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB38P57729 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB38P57729 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB38P57729 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB38P57729 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB38P57729 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB38P57729 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB38P57729 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB38P57729 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB38P57729 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB38P57729 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB38P57729 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB38P57729 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB38P57729 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB38P57729 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB38P57729 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB38P57729 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB38P57729 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB38P57729 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB38P57729 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB38P57729 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB38P57729 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB38P57729 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB38P57729 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB38P57729 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB38P57729 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB38P57729 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB38P57729 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB38P57729 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB38P57729 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB38P57729 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB38P57729 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB38P57729 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB38P57729 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB38P57729 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB38P57729 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB38P57729 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB38P57729 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB38P57729 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB38P57729 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB38P57729 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB38P57729 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB38P57729 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB38P57729 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB38P57729 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB38P57729 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB38P57729 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB38P57729 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB38P57729 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB38P57729 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB38P57729 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB38P57729 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB38P57729 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms