Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCKAP1LP55160 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCKAP1LP55160 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCKAP1LP55160 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCKAP1LP55160 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCKAP1LP55160 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCKAP1LP55160 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NCKAP1LP55160 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
NCKAP1LP55160 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NCKAP1LP55160 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NCKAP1LP55160 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCKAP1LP55160 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCKAP1LP55160 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCKAP1LP55160 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCKAP1LP55160 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCKAP1LP55160 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCKAP1LP55160 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NCKAP1LP55160 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCKAP1LP55160 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCKAP1LP55160 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCKAP1LP55160 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCKAP1LP55160 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCKAP1LP55160 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCKAP1LP55160 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCKAP1LP55160 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCKAP1LP55160 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCKAP1LP55160 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCKAP1LP55160 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NCKAP1LP55160 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms