Protein–RNA interactions for Protein: P53804

TTC3, E3 ubiquitin-protein ligase TTC3, humanhuman

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3P53804 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC3P53804 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC3P53804 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC3P53804 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC3P53804 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC3P53804 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC3P53804 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC3P53804 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC3P53804 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC3P53804 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC3P53804 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC3P53804 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC3P53804 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC3P53804 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC3P53804 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC3P53804 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC3P53804 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC3P53804 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC3P53804 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC3P53804 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC3P53804 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC3P53804 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC3P53804 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC3P53804 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC3P53804 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC3P53804 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC3P53804 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC3P53804 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTC3P53804 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC3P53804 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC3P53804 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC3P53804 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC3P53804 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC3P53804 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC3P53804 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC3P53804 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC3P53804 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC3P53804 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC3P53804 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC3P53804 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC3P53804 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC3P53804 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC3P53804 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC3P53804 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC3P53804 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC3P53804 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC3P53804 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC3P53804 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC3P53804 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC3P53804 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC3P53804 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC3P53804 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC3P53804 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC3P53804 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC3P53804 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC3P53804 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC3P53804 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC3P53804 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC3P53804 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC3P53804 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC3P53804 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC3P53804 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC3P53804 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC3P53804 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC3P53804 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC3P53804 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC3P53804 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC3P53804 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC3P53804 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC3P53804 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC3P53804 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC3P53804 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC3P53804 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC3P53804 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC3P53804 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TTC3P53804 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTC3P53804 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TTC3P53804 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC3P53804 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC3P53804 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC3P53804 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC3P53804 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TTC3P53804 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TTC3P53804 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTC3P53804 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TTC3P53804 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TTC3P53804 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TTC3P53804 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC3P53804 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TTC3P53804 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TTC3P53804 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TTC3P53804 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTC3P53804 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC3P53804 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC3P53804 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC3P53804 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC3P53804 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC3P53804 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC3P53804 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC3P53804 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms