Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CLTCL1P53675 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CLTCL1P53675 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CLTCL1P53675 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CLTCL1P53675 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
CLTCL1P53675 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CLTCL1P53675 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CLTCL1P53675 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CLTCL1P53675 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CLTCL1P53675 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CLTCL1P53675 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
CLTCL1P53675 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
CLTCL1P53675 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CLTCL1P53675 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CLTCL1P53675 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CLTCL1P53675 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CLTCL1P53675 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CLTCL1P53675 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CLTCL1P53675 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CLTCL1P53675 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CLTCL1P53675 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CLTCL1P53675 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
CLTCL1P53675 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CLTCL1P53675 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CLTCL1P53675 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
CLTCL1P53675 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
CLTCL1P53675 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CLTCL1P53675 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CLTCL1P53675 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CLTCL1P53675 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CLTCL1P53675 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CLTCL1P53675 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CLTCL1P53675 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CLTCL1P53675 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CLTCL1P53675 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CLTCL1P53675 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CLTCL1P53675 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CLTCL1P53675 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CLTCL1P53675 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CLTCL1P53675 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CLTCL1P53675 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CLTCL1P53675 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
CLTCL1P53675 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CLTCL1P53675 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CLTCL1P53675 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CLTCL1P53675 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CLTCL1P53675 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CLTCL1P53675 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CLTCL1P53675 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CLTCL1P53675 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CLTCL1P53675 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CLTCL1P53675 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CLTCL1P53675 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CLTCL1P53675 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.5
CLTCL1P53675 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
CLTCL1P53675 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CLTCL1P53675 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CLTCL1P53675 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CLTCL1P53675 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
CLTCL1P53675 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CLTCL1P53675 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLTCL1P53675 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
CLTCL1P53675 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLTCL1P53675 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLTCL1P53675 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLTCL1P53675 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLTCL1P53675 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CLTCL1P53675 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CLTCL1P53675 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CLTCL1P53675 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLTCL1P53675 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLTCL1P53675 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLTCL1P53675 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLTCL1P53675 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLTCL1P53675 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
CLTCL1P53675 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CLTCL1P53675 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CLTCL1P53675 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLTCL1P53675 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLTCL1P53675 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CLTCL1P53675 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms