Protein–RNA interactions for Protein: P49748

ACADVL, Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADVLP49748 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACADVLP49748 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACADVLP49748 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACADVLP49748 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACADVLP49748 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACADVLP49748 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACADVLP49748 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACADVLP49748 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACADVLP49748 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACADVLP49748 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACADVLP49748 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACADVLP49748 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ACADVLP49748 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACADVLP49748 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACADVLP49748 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms