Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALDH1A3P47895 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALDH1A3P47895 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH1A3P47895 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH1A3P47895 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH1A3P47895 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALDH1A3P47895 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALDH1A3P47895 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALDH1A3P47895 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ALDH1A3P47895 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALDH1A3P47895 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALDH1A3P47895 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALDH1A3P47895 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ALDH1A3P47895 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALDH1A3P47895 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALDH1A3P47895 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ALDH1A3P47895 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALDH1A3P47895 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALDH1A3P47895 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH1A3P47895 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH1A3P47895 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH1A3P47895 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH1A3P47895 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH1A3P47895 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH1A3P47895 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALDH1A3P47895 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALDH1A3P47895 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALDH1A3P47895 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALDH1A3P47895 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALDH1A3P47895 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALDH1A3P47895 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALDH1A3P47895 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALDH1A3P47895 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms