Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSPAN7P41732 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN7P41732 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN7P41732 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN7P41732 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN7P41732 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN7P41732 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN7P41732 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN7P41732 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN7P41732 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN7P41732 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN7P41732 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN7P41732 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN7P41732 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN7P41732 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN7P41732 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN7P41732 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN7P41732 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN7P41732 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN7P41732 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN7P41732 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN7P41732 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN7P41732 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN7P41732 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms