Protein–RNA interactions for Protein: P41161

ETV5, ETS translocation variant 5, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV5P41161 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETV5P41161 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETV5P41161 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETV5P41161 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETV5P41161 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETV5P41161 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETV5P41161 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETV5P41161 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETV5P41161 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETV5P41161 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETV5P41161 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETV5P41161 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETV5P41161 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ETV5P41161 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ETV5P41161 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ETV5P41161 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ETV5P41161 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ETV5P41161 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ETV5P41161 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ETV5P41161 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETV5P41161 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETV5P41161 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETV5P41161 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETV5P41161 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ETV5P41161 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ETV5P41161 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ETV5P41161 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ETV5P41161 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ETV5P41161 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ETV5P41161 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ETV5P41161 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ETV5P41161 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ETV5P41161 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ETV5P41161 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ETV5P41161 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETV5P41161 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETV5P41161 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETV5P41161 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ETV5P41161 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ETV5P41161 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ETV5P41161 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETV5P41161 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETV5P41161 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETV5P41161 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETV5P41161 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETV5P41161 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETV5P41161 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ETV5P41161 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETV5P41161 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ETV5P41161 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETV5P41161 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ETV5P41161 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ETV5P41161 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ETV5P41161 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ETV5P41161 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ETV5P41161 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ETV5P41161 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ETV5P41161 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ETV5P41161 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ETV5P41161 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ETV5P41161 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ETV5P41161 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ETV5P41161 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ETV5P41161 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ETV5P41161 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ETV5P41161 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ETV5P41161 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ETV5P41161 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ETV5P41161 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ETV5P41161 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ETV5P41161 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ETV5P41161 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ETV5P41161 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ETV5P41161 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ETV5P41161 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ETV5P41161 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ETV5P41161 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ETV5P41161 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ETV5P41161 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ETV5P41161 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ETV5P41161 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ETV5P41161 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ETV5P41161 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ETV5P41161 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ETV5P41161 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ETV5P41161 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ETV5P41161 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ETV5P41161 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ETV5P41161 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ETV5P41161 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ETV5P41161 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ETV5P41161 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ETV5P41161 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ETV5P41161 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ETV5P41161 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ETV5P41161 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ETV5P41161 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ETV5P41161 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ETV5P41161 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ETV5P41161 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms