Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD12P35452 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD12P35452 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD12P35452 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD12P35452 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD12P35452 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD12P35452 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD12P35452 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD12P35452 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD12P35452 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD12P35452 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD12P35452 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD12P35452 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD12P35452 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD12P35452 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD12P35452 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD12P35452 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD12P35452 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD12P35452 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD12P35452 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD12P35452 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD12P35452 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms