Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPRR1AP35321 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR1AP35321 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPRR1AP35321 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms