Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDX6P30041 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDX6P30041 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDX6P30041 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRDX6P30041 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms