Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A2P23975 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A2P23975 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A2P23975 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A2P23975 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A2P23975 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC6A2P23975 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC6A2P23975 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A2P23975 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A2P23975 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC6A2P23975 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A2P23975 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms