Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3BP20337 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB3BP20337 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3BP20337 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms