Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF1P18846 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF1P18846 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF1P18846 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF1P18846 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF1P18846 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF1P18846 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF1P18846 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF1P18846 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF1P18846 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF1P18846 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF1P18846 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF1P18846 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF1P18846 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF1P18846 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF1P18846 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF1P18846 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF1P18846 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF1P18846 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF1P18846 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF1P18846 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF1P18846 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF1P18846 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF1P18846 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF1P18846 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF1P18846 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF1P18846 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF1P18846 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF1P18846 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF1P18846 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF1P18846 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF1P18846 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF1P18846 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF1P18846 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF1P18846 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF1P18846 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF1P18846 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF1P18846 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF1P18846 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATF1P18846 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATF1P18846 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF1P18846 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF1P18846 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF1P18846 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF1P18846 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF1P18846 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF1P18846 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF1P18846 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF1P18846 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF1P18846 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF1P18846 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF1P18846 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF1P18846 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF1P18846 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF1P18846 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF1P18846 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF1P18846 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF1P18846 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF1P18846 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF1P18846 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF1P18846 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF1P18846 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF1P18846 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF1P18846 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF1P18846 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF1P18846 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF1P18846 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF1P18846 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF1P18846 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF1P18846 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF1P18846 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF1P18846 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF1P18846 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF1P18846 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF1P18846 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF1P18846 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF1P18846 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF1P18846 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF1P18846 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF1P18846 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF1P18846 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF1P18846 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF1P18846 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF1P18846 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF1P18846 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF1P18846 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF1P18846 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF1P18846 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF1P18846 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF1P18846 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF1P18846 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF1P18846 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF1P18846 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF1P18846 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF1P18846 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF1P18846 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF1P18846 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF1P18846 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF1P18846 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF1P18846 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms