Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELFEP18615 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELFEP18615 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELFEP18615 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NELFEP18615 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NELFEP18615 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NELFEP18615 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NELFEP18615 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELFEP18615 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NELFEP18615 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELFEP18615 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELFEP18615 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELFEP18615 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NELFEP18615 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NELFEP18615 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NELFEP18615 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELFEP18615 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELFEP18615 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELFEP18615 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NELFEP18615 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NELFEP18615 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NELFEP18615 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NELFEP18615 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NELFEP18615 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NELFEP18615 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELFEP18615 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELFEP18615 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELFEP18615 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELFEP18615 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NELFEP18615 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELFEP18615 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NELFEP18615 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NELFEP18615 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NELFEP18615 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELFEP18615 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELFEP18615 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELFEP18615 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELFEP18615 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NELFEP18615 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NELFEP18615 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NELFEP18615 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NELFEP18615 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NELFEP18615 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NELFEP18615 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELFEP18615 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELFEP18615 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELFEP18615 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NELFEP18615 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELFEP18615 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELFEP18615 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELFEP18615 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELFEP18615 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELFEP18615 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELFEP18615 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELFEP18615 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELFEP18615 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NELFEP18615 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NELFEP18615 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NELFEP18615 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NELFEP18615 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NELFEP18615 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NELFEP18615 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NELFEP18615 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NELFEP18615 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NELFEP18615 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NELFEP18615 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NELFEP18615 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NELFEP18615 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NELFEP18615 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NELFEP18615 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NELFEP18615 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NELFEP18615 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NELFEP18615 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NELFEP18615 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NELFEP18615 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NELFEP18615 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NELFEP18615 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NELFEP18615 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NELFEP18615 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NELFEP18615 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NELFEP18615 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NELFEP18615 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NELFEP18615 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NELFEP18615 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NELFEP18615 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NELFEP18615 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NELFEP18615 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NELFEP18615 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NELFEP18615 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NELFEP18615 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NELFEP18615 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NELFEP18615 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NELFEP18615 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NELFEP18615 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NELFEP18615 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFEP18615 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFEP18615 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFEP18615 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFEP18615 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFEP18615 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms