Protein–RNA interactions for Protein: P13591

NCAM1, Neural cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM1P13591 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCAM1P13591 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCAM1P13591 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCAM1P13591 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCAM1P13591 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCAM1P13591 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCAM1P13591 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCAM1P13591 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCAM1P13591 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCAM1P13591 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAM1P13591 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAM1P13591 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAM1P13591 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAM1P13591 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAM1P13591 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCAM1P13591 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCAM1P13591 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCAM1P13591 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCAM1P13591 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCAM1P13591 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCAM1P13591 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NCAM1P13591 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NCAM1P13591 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCAM1P13591 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCAM1P13591 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NCAM1P13591 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCAM1P13591 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCAM1P13591 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCAM1P13591 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCAM1P13591 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCAM1P13591 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCAM1P13591 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 276.4 ms