Protein–RNA interactions for Protein: P13473

LAMP2, Lysosome-associated membrane glycoprotein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP2P13473 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMP2P13473 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMP2P13473 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMP2P13473 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMP2P13473 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMP2P13473 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMP2P13473 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMP2P13473 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMP2P13473 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMP2P13473 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMP2P13473 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMP2P13473 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMP2P13473 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMP2P13473 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMP2P13473 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMP2P13473 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMP2P13473 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMP2P13473 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAMP2P13473 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMP2P13473 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMP2P13473 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMP2P13473 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMP2P13473 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMP2P13473 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMP2P13473 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMP2P13473 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMP2P13473 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMP2P13473 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMP2P13473 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMP2P13473 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms