Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOP08100 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOP08100 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOP08100 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOP08100 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOP08100 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RHOP08100 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RHOP08100 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOP08100 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOP08100 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOP08100 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOP08100 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHOP08100 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHOP08100 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHOP08100 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHOP08100 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOP08100 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOP08100 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOP08100 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOP08100 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOP08100 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOP08100 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOP08100 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOP08100 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOP08100 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOP08100 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHOP08100 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHOP08100 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RHOP08100 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RHOP08100 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOP08100 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOP08100 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOP08100 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOP08100 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOP08100 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHOP08100 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHOP08100 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHOP08100 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHOP08100 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHOP08100 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHOP08100 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RHOP08100 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHOP08100 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHOP08100 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHOP08100 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHOP08100 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHOP08100 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHOP08100 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHOP08100 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHOP08100 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RHOP08100 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RHOP08100 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHOP08100 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHOP08100 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHOP08100 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHOP08100 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHOP08100 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHOP08100 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHOP08100 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHOP08100 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHOP08100 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHOP08100 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHOP08100 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHOP08100 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHOP08100 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHOP08100 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHOP08100 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RHOP08100 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOP08100 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOP08100 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOP08100 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOP08100 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOP08100 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOP08100 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOP08100 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOP08100 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHOP08100 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RHOP08100 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RHOP08100 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHOP08100 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHOP08100 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHOP08100 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RHOP08100 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHOP08100 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHOP08100 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHOP08100 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHOP08100 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHOP08100 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOP08100 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOP08100 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOP08100 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOP08100 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOP08100 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOP08100 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOP08100 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHOP08100 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHOP08100 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHOP08100 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHOP08100 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHOP08100 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms