Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPM3P06753 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPM3P06753 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TPM3P06753 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPM3P06753 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPM3P06753 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPM3P06753 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPM3P06753 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPM3P06753 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPM3P06753 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPM3P06753 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPM3P06753 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPM3P06753 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPM3P06753 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TPM3P06753 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPM3P06753 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPM3P06753 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPM3P06753 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPM3P06753 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPM3P06753 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPM3P06753 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TPM3P06753 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TPM3P06753 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPM3P06753 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPM3P06753 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPM3P06753 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPM3P06753 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPM3P06753 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPM3P06753 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPM3P06753 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPM3P06753 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPM3P06753 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPM3P06753 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPM3P06753 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPM3P06753 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPM3P06753 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPM3P06753 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TPM3P06753 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TPM3P06753 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TPM3P06753 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TPM3P06753 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPM3P06753 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TPM3P06753 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPM3P06753 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPM3P06753 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPM3P06753 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPM3P06753 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPM3P06753 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPM3P06753 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TPM3P06753 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPM3P06753 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPM3P06753 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPM3P06753 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPM3P06753 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPM3P06753 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPM3P06753 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPM3P06753 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPM3P06753 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPM3P06753 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPM3P06753 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPM3P06753 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPM3P06753 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPM3P06753 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPM3P06753 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPM3P06753 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPM3P06753 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TPM3P06753 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPM3P06753 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPM3P06753 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPM3P06753 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPM3P06753 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPM3P06753 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TPM3P06753 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPM3P06753 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TPM3P06753 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPM3P06753 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPM3P06753 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TPM3P06753 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPM3P06753 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPM3P06753 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPM3P06753 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPM3P06753 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TPM3P06753 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPM3P06753 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TPM3P06753 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TPM3P06753 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TPM3P06753 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TPM3P06753 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TPM3P06753 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPM3P06753 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TPM3P06753 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPM3P06753 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TPM3P06753 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TPM3P06753 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPM3P06753 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPM3P06753 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPM3P06753 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPM3P06753 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPM3P06753 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TPM3P06753 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.5 ms