Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK1P06493 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK1P06493 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK1P06493 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK1P06493 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK1P06493 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK1P06493 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK1P06493 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK1P06493 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK1P06493 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK1P06493 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK1P06493 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK1P06493 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK1P06493 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK1P06493 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK1P06493 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK1P06493 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK1P06493 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK1P06493 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK1P06493 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK1P06493 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK1P06493 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK1P06493 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK1P06493 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK1P06493 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK1P06493 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK1P06493 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK1P06493 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK1P06493 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK1P06493 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK1P06493 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK1P06493 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK1P06493 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK1P06493 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK1P06493 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK1P06493 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK1P06493 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK1P06493 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK1P06493 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK1P06493 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK1P06493 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK1P06493 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK1P06493 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK1P06493 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK1P06493 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK1P06493 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK1P06493 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK1P06493 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK1P06493 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK1P06493 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK1P06493 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK1P06493 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK1P06493 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK1P06493 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK1P06493 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK1P06493 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK1P06493 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK1P06493 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK1P06493 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK1P06493 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK1P06493 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK1P06493 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK1P06493 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK1P06493 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK1P06493 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK1P06493 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK1P06493 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK1P06493 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK1P06493 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK1P06493 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK1P06493 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK1P06493 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK1P06493 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK1P06493 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK1P06493 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK1P06493 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK1P06493 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK1P06493 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK1P06493 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK1P06493 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK1P06493 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK1P06493 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK1P06493 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK1P06493 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK1P06493 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK1P06493 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK1P06493 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK1P06493 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK1P06493 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK1P06493 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK1P06493 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK1P06493 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK1P06493 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK1P06493 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK1P06493 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK1P06493 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK1P06493 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK1P06493 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK1P06493 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK1P06493 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms