Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MYCNP04198 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MYCNP04198 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYCNP04198 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MYCNP04198 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYCNP04198 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYCNP04198 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYCNP04198 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYCNP04198 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYCNP04198 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYCNP04198 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MYCNP04198 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYCNP04198 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYCNP04198 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYCNP04198 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYCNP04198 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYCNP04198 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYCNP04198 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYCNP04198 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYCNP04198 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYCNP04198 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYCNP04198 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYCNP04198 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYCNP04198 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYCNP04198 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MYCNP04198 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYCNP04198 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYCNP04198 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYCNP04198 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYCNP04198 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYCNP04198 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYCNP04198 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYCNP04198 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYCNP04198 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
MYCNP04198 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYCNP04198 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYCNP04198 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYCNP04198 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYCNP04198 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYCNP04198 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYCNP04198 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYCNP04198 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYCNP04198 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYCNP04198 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYCNP04198 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MYCNP04198 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYCNP04198 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYCNP04198 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYCNP04198 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYCNP04198 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYCNP04198 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYCNP04198 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYCNP04198 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYCNP04198 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYCNP04198 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYCNP04198 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYCNP04198 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYCNP04198 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYCNP04198 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYCNP04198 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYCNP04198 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MYCNP04198 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYCNP04198 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYCNP04198 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYCNP04198 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MYCNP04198 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYCNP04198 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYCNP04198 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYCNP04198 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYCNP04198 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYCNP04198 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYCNP04198 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MYCNP04198 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYCNP04198 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MYCNP04198 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYCNP04198 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYCNP04198 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYCNP04198 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYCNP04198 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYCNP04198 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYCNP04198 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYCNP04198 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYCNP04198 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYCNP04198 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYCNP04198 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYCNP04198 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYCNP04198 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYCNP04198 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYCNP04198 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYCNP04198 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYCNP04198 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYCNP04198 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYCNP04198 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYCNP04198 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYCNP04198 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYCNP04198 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYCNP04198 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYCNP04198 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYCNP04198 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYCNP04198 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms