Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED1O96006 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED1O96006 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED1O96006 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED1O96006 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED1O96006 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED1O96006 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED1O96006 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED1O96006 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED1O96006 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED1O96006 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED1O96006 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED1O96006 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED1O96006 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED1O96006 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED1O96006 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED1O96006 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED1O96006 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED1O96006 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED1O96006 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED1O96006 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED1O96006 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED1O96006 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED1O96006 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED1O96006 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED1O96006 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED1O96006 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED1O96006 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED1O96006 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED1O96006 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED1O96006 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED1O96006 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED1O96006 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED1O96006 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
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